在距今4.9-4.7億年和3.4-3億年前,地球發(fā)生了兩次生物多樣性快速增加,而當(dāng)時(shí)的全球氣候卻在逐漸變冷。歷經(jīng)多年研究,南京大學(xué)、中國(guó)科學(xué)院南京地質(zhì)古生物所的樊雋軒教授、沈樹忠院士團(tuán)隊(duì),借助“天河二號(hào)”超級(jí)計(jì)算機(jī),運(yùn)用大數(shù)據(jù)、超算、遺傳算法等全新的方法和手段,獲得了全新的寒武紀(jì)-早三疊世海洋無脊椎動(dòng)物的復(fù)合多樣性曲線,將統(tǒng)計(jì)時(shí)間分辨率從1000萬年精細(xì)到約2.6萬年,較國(guó)際同類研究的精度提高了400倍左右,更加準(zhǔn)確地重現(xiàn)了地質(zhì)歷史中三次生物大滅絕事件和兩次重大生物輻射事件的精細(xì)過程。1月17日,該成果在《科學(xué)》雜志在線發(fā)表。

中國(guó)古生代高分辨率海洋生物多樣性曲線。金鳳 攝
17年的計(jì)算量2-3天就能完成
生命演化中有三個(gè)基本問題,即地球上復(fù)雜的生態(tài)系統(tǒng)是如何形成的?生命如何從一種形式演化到另一種形式?人類出現(xiàn)之前的地球生物圈是否存在災(zāi)變和生物多樣性事件?
如今,地球上曾經(jīng)生活過的生物中99%以上已經(jīng)滅絕,但只有很少一部分能保存為化石,如何通過不完整的化石記錄重建地球歷史生物多樣性的變化規(guī)律是一個(gè)重大科學(xué)難題。

5億年前的三葉蟲化石。南大供圖
“上世紀(jì)八九十年代,科級(jí)、屬級(jí)的顯生宙生物多樣性曲線,已經(jīng)可以將地層剖面中保存的海洋生物化石所反映的不同時(shí)代的信息,精確到800-1000多萬年,如果想建立更加精確的時(shí)間標(biāo)尺,看到更小時(shí)間段內(nèi),地球發(fā)生了哪些生命演化,就需要完成大量的化石生物多樣性的計(jì)算。”南京大學(xué)地球科學(xué)與工程學(xué)院副教授史宇坤介紹,當(dāng)統(tǒng)計(jì)的物種數(shù)量上升到1萬個(gè)時(shí),用傳統(tǒng)的計(jì)算機(jī)需要計(jì)算17.3年。
在地球歷史中,曾經(jīng)發(fā)生過重大的生態(tài)系統(tǒng)和環(huán)境的突變,導(dǎo)致了多次生物大滅絕事件。利用古生物數(shù)據(jù)庫(kù)重建地質(zhì)歷史全球生物多樣性模式,揭示地球生命的演化歷史,以及與環(huán)境變化之間的關(guān)系,可以為了解當(dāng)前的地球生物多樣性危機(jī)提供重要啟示。
團(tuán)隊(duì)研究人員表明,前人使用的低分辨率且不均一的時(shí)間標(biāo)尺,難以準(zhǔn)確重現(xiàn)生命演化的精細(xì)過程,會(huì)直接影響對(duì)古生物多樣性的估算,導(dǎo)致無法準(zhǔn)確評(píng)估生物多樣性的變化速率和模式,并可能掩蓋突發(fā)性的重大事件以及短時(shí)間的劇烈波動(dòng)。
為了建立約5.4億年-2.4億年前、寒武紀(jì)至三疊紀(jì)早期海洋生物多樣性曲線,南京大學(xué)教授樊雋軒等收集了大量的地層剖面和化石記錄,從中遴選了3112個(gè)地層剖面、11268個(gè)海洋化石物種的26萬個(gè)化石數(shù)據(jù)。
如何讓這些海量數(shù)據(jù)精確、迅速地分析地球生命演化信息?史宇坤介紹,研究團(tuán)隊(duì)結(jié)合模擬退火算法和遺傳算法,自主開發(fā)了基于并行計(jì)算的約束最優(yōu)化方法-CONOP.SAGA。他們利用“天河二號(hào)”超級(jí)計(jì)算機(jī),經(jīng)過反復(fù)計(jì)算和驗(yàn)證,將17年才能完成的計(jì)算提高到2-3天就能完成,并最終獲得了全新的寒武紀(jì)-早三疊世海洋無脊椎動(dòng)物的復(fù)合多樣性曲線,將生物多樣性的分辨率從1000多萬年精細(xì)到2.6萬年,精度提高了400倍左右。
“以往有關(guān)化石生物多樣性的統(tǒng)計(jì)分析的數(shù)據(jù)很粗,每個(gè)時(shí)間段大約跨越1000萬年,但我們通過大數(shù)據(jù)、超算、定量化技術(shù),可以精細(xì)地看到幾萬年內(nèi)發(fā)生的生物多樣性的變化以及環(huán)境的變化,這對(duì)于當(dāng)今生物多樣性如何受環(huán)境和氣候的影響,提供了重要的啟示。”中國(guó)科學(xué)院院士、南京大學(xué)教授沈樹忠說。

南京大學(xué)樊雋軒教授(左三)、沈樹忠院士(右二)等分析大數(shù)據(jù)計(jì)算的結(jié)果,南大供圖
4.9-4.7億年前和3.4-3億年前全球變冷,生物多樣性反而增加
新建立的多樣性變化曲線,更準(zhǔn)確地重現(xiàn)了地質(zhì)歷史中三次生物大滅絕事件和兩次重大生物輻射事件的精細(xì)過程。
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